Entschlüsselung von Proteinfunktionen mit Hilfe des Computers: Erkennung und Interpretation entfernter Sequenzähnlichkeiten

Zusammenfassung

Anhand verschiedener Beispiele wird versucht, die Möglichkeiten der Sequenzanalyse bei der Erklärung von molekularer Proteinfunktion aufzuzeigen. Den Hauptanteil machen dabei die Homologiesuchen aus, die auf heuristischen Methoden basieren. Schon heute sind sie unverzichtbarer Bestandteil in allen an Genomprojekten beteiligten Labors. Doch eine sensitive Auswertung der Sequenzdaten erfordert eine Kombination vieler zusätzlicher Methoden, wie Aminosäurekompositions-, Stammbaum-, Muster- und Strukturanalysen. Trotz erstaunlich guter Ergebnisse bei Testbeispielen ist einerseits eine Automatisierung bei komplexen Aufgaben, wie der Analyse eines ganzen Chromosomes, andererseits eine Erhöhung der Sensitivität bei Detailproblemen wie Bindungsstellenvorhersage nötig.