Kurzfassung
Traktographiealgorithmen liefern potentiell wertvolle Informationen für die Neurochirurgie sowie für automatisierte Diagnoseans ätze. Dennoch werden sie im klinischen Umfeld bisher kaum oder gar nicht eingesetzt. In diesem Paper präsentieren wir eine open-source Integration des von Reisert et al. vorgestellten globalen Tracking-Algorithmus in das open-source Medical Imaging Interaction Toolkit (MITK) welches von der Abteilung für Medizinische und Biologische Informatik am Deutschen Krebsforschungszentrum (DKFZ) entwickelt wird. Die Integration dieses Algorithmus in eine standardisierte und offene Entwicklungsumgebung wie MITK erleichtert die Zugänglichkeit von Traktographiealgorithmen für die Wissenschaftsgemeinschaft und ist ein wichtiger Schritt in Richtung klinischer Anwendungen. Die MITK Diffusion Anwendung, verfügbar auf www.mitk.org, beinhaltet alle Schritte die für eine erfolgreiche Traktographie notwendig sind: Vorverarbeitung, Rekonstruktion der Bilder, das eigentliche Tracking, live Beobachtung von Zwischenergebnissen, Nachbearbeitung und Visualisierung der Tracking-Ergebnisse. Dieses Paper beschreibt typische Tracking-Ergebnisse und demonstriert die Schritte die zur Vor- und Nachbearbeitung der Bilder und Ergebnisse durchgeführt werden.
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Literaturverzeichnis
Fillard P, Descoteaux M, Goh A, et al. Quantitative evaluation of 10 tractography algorithms on a realistic diffusion MR phantom. Neuroimage. 2011;56(1):220–34. Available from: http://dx.doi.org/10.1016/j.neuroimage.2011.01.032.
Kreher BW, Mader I, Kiselev VG. Gibbs tracking: a novel approach for the reconstruction of neuronal pathways. Magn Reson Med. 2008;60(4):953–63. Available from: http://dx.doi.org/10.1002/mrm.21749.
Reisert M, Mader I, Anastasopoulos C, et al. Global fiber reconstruction becomes practical. Neuroimage. 2011;54:955–62.
Fritzsche K, Meinzer HP. MITK-DI A new diffusion imaging component for MITK. Proc BVM. 2010.
Wolf I, Vetter M, Wegner I, et al. The medical imaging interaction toolkit. Med Image Anal. 2005;9(6):594–604.
Tuch DS. Q-ball imaging. Magn Reson Med. 2004;52:1358–72.
Descoteaux M, Angelino E, Fitzgibbons S, et al. Regularized, fast, and robust analytical Q-ball imaging. Magn Reson Med. 2007;58:497–510.
Aganj I, Lenglet C, Sapiro G. ODF reconstruction in q-ball imaging with solid angle consideration. Proc IEEE ISBI. 2009.
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Neher, P.F., Stieltjes, B., Reisert, M., Reicht, I., Meinzer, HP., Fritzsche, K.H. (2012). Integration eines globalen Traktographieverfahrens in das Medical Imaging Interaction Toolkit. In: Tolxdorff, T., Deserno, T., Handels, H., Meinzer, HP. (eds) Bildverarbeitung für die Medizin 2012. Informatik aktuell. Springer, Berlin, Heidelberg. https://doi.org/10.1007/978-3-642-28502-8_32
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