Zusammenfassung
Beschrieben wird ein wissensbasiertes System zur Simulation der makromolekularen Erkennung beim Protein-Proteindocking, das eine Anwendung des semantischen Netzwerksystems ERNEST darstellt. Die Simulation baut auf den dreidimensionalen Atomkoordinaten für strukturaufgelöste Proteine und der auf deren Grundlage berechneten und segmentierten Proteinoberfläche auf. Geometrische und chemische Merkmale der Proteine und ihrer Oberflächensegmente werden von Polynomklassifikatoren genutzt, um für die während einer Analyse generierten groben Dockingkonstellationen Bewertungen zu erhalten, die in entscheidendem Maß in die für das System entwickelte Kontrollstrategie einfließen. Die Güte der Bewertungen wird an den tatsächlichen Dockingstellen gemessen, die für experimentell bestimmte Komplexstrukturen berechnet wurden.
Robert Bosch GmbH, Hildesheim
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Literatur
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© 1997 Springer-Verlag Berlin Heidelberg
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Herrmann, G., Kummert, F., Posch, S., Sagerer, G. (1997). Bewertungsmaße für ein wissensbasiertes System zur makromolekularen Erkennung. In: Paulus, E., Wahl, F.M. (eds) Mustererkennung 1997. Informatik aktuell. Springer, Berlin, Heidelberg. https://doi.org/10.1007/978-3-642-60893-3_66
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