Zusammenfassung
Biologische Modellorganismen wie z. B. die Eier des Zebrafischs müssen für Experimente in der Regel zunächst in Mikrotiterplatten einsortiert werden, damit sie mikroskopiert werden können. Die Auswertung des dabei gewonnenen Bildmaterials erfolgt anschließend, wie die anderen Prozessschritte auch, meist manuell. Aus diesem Grund wurden Systeme zur Automatisierung der verschiedenen Prozessschritte am Institut für Angewandte Informatik entwickelt. Die ausgewählten Beispiele beinhalten das automatische Sortieren von Zebrafischeiern durch einen Roboter ohne die Einwirkung von sichtbarem Licht, die daran anschließende automatisierte Detektion von motorischen Reaktionen der Fischeier auf optische Reize und ein System zur automatisierten Verhaltensbeobachtung adulter Fische.
Abstract
In order to experiment with biological model organisms, manual sample preparation is usually necessary. With zebrafish eggs this means manual pipetting into microtiter plates, before they can be used in any chemical or behavioral studies. The analysis of the resulting data is most of the time also still done manually. Thus systems for the automation of these steps were developed at the Institute for Applied Computer Science. The chosen examples include the automated sorting of zebrafish eggs via a robot capable of functioning without visible light, the detection of motor reactions in zebrafish embryos in response to optical stimuli as well as a system for automated behavioral studies of adult fish.
Über die Autoren
Institut für Toxikologie und Genetik, Karlsruher Institut für Technologie (KIT), Hermann-von-Helmholtz-Platz 1, 76344 Eggenstein-Leopoldshafen
Institut für Angewandte Informatik, Karlsruher Institut für Technologie (KIT), Hermann-von-Helmholtz-Platz 1, 76344 Eggenstein-Leopoldshafen
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Danksagung
Die Autoren bedanken sich bei ihren Kooperationspartnern aus dem Institut für Toxikologie und Genetik (ITG) des Karlsruher Instituts für Technologie (KIT), insbesondere Dr. Thomas Dickmeis, Dr. Felix Loosli und Prof. Dr. Uwe Strähle.
©2016 Walter de Gruyter Berlin/Boston
